A altura das árvores varia entre 25 a 35m, com emergentes maiores de 40m de altura. Sua estrutura é semelhante à Floresta de Terra Firme (Floresta Ombrófila Densa Submontana). No entanto, sua composição florística difere pela ausência de algumas espécies comuns na Floresta Ombrófila Densa, como a castanheira. O sub-bosque é freqüentemente mais denso, com muitos cipós. A composição florística é uma combinação de espécies perenifólias e deciduais.
Cipós na Floresta Semidecídua do Cristalino.
A maior parte do seu dossel perde parcialmente sua folhagem durante alguns meses mais secos do ano. Existem também mais espécies de palmeiras. O solo é mais arenoso com coloração marrom escuro. Uma camada espessa de herbáceas pode estar presente no nível do solo, como gramíneas e musgos.
Algumas espécies de árvores de grande porte presentes incluem o Jataipeva (Dialium guianense), Ingá (Inga sp.), Swartzia sp., Tamboril (Enterolobium sp.), Champanhe (Dipteryx odorata), Hymenaea parvifolia e Dimorphandra sp.. Árvores da família Sapotaceae e Apocynaceae também são comuns.